為持續有效地監測傳染病，掌握傳染病在澳門特別行政區的流行趨勢，衛生局根據《傳染病防治法》及《傳染病強制申報機制》規定公共或私人醫療機構的負責人、作出首次診斷的醫生或填寫死亡證明書的醫生和作出實驗室診斷的技術人員，有義務在法定時間內向衛生局申報其在履行職務時所發現的傳染病個案。現時，共有44類疾病需作出申報，而衛生局會對收集的申報數據作出分析評估，制定和調整相關傳染病的防控措施。衛生局亦會每月公佈相關監測數據，讓公眾掌握澳門傳染病的發展趨勢。
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